合肥离子医学中心(以下简称中心)成立于2015年，由合肥市人民政府与中国科学院合肥物质科学研究院合作共建，引进国际先进成熟的质子治疗系统，建设现代化质子治疗中心，建立放疗人才培训中心、国际学术交流中心和自主研制国产质子治疗系统的验证基地。2019年经省卫生健康委批复成为中国科大附一院医疗延伸点一一中国科学技术大学附属第一医院离子医学中心(合肥离子医学中心)。

中心位于合肥高新区长宁大道1700号，一期质子治疗项目占地约70亩，建筑面积约3.4万平米，是一所集医疗、科研、教学于一身，以质子放射治疗技术为主要治疗手段，同时提供直线加速器放射治疗的现代化、国际化癌症治疗中心。二期首台套国产质子治疗系统医疗验证基地项目占地约24亩，建筑面积约1.4万平米，建成后将作为国产首台质子治疗设备的放置点和未来国产质子装备走向市场化的“样板间”。

中心一期引进国际成熟、先进的瓦里安ProBeam多室质子治疗系统(含旋转束治疗室3间、固定束治疗室1间、科研实验室1间)。治疗系统集成了瓦里安先进的治疗计划系统、放疗信息管理系统、影像系统，同时配备最新笔形束扫描技术及六维机器人摆位系统。二期配置合肥中科离子医学技术装备有限公司自主研制的国产Capro-X1质子治疗系统(含旋转束治疗室1间、固定束治疗室1间)。治疗系统配置了轻量化360度旋转治疗机架、高性能高精度的质子能量选择系统，拥有国内最大成像视野的CBCT图像引导系统，具备一体化质子放疗诊疗能力。