4月15日，合肥离子医学中心关于质子治疗系统和技术服务（含建工设计）项目的国际招标公告在中国国际招标网和安徽合肥公共资源交易中心网站同时发布，合肥离子医学中心项目国际招标正式拉开帷幕。

3月30日下午，由合肥离子医学中心主办的“2016高端医学论坛—质子医疗与人类健康”在合肥市政务中心成功举办，来自于世界各地的专家、学者济济一堂,分享癌症治疗领域的最新成果。

2月23日，合肥市委组织部在合肥离子医学中心召开干部任命大会，市委组织部副部长吴松保出席会议并作重要讲话，市委组织部企事业干部处处长张海燕，市国资委企事业人员管理处处长张曙和、市产投集团董事、副总经理、合肥离子医学中心有限公司董事长、总经理袁飞等领导出席了会议。

10月10日下午，合肥市政府与中科院合肥物质科学研究院正式签署战略合作协议，双方将共同建设“合肥离子医学中心”。